Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms