Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HACD1B0YJ81 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms