Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms