Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms