Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XIRP2A4UGR9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms