Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTMR11A4FU01 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms