Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms