Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP3Q9Y446 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms