Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms