Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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