Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms