Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL28Q9NXS3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms