Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHBDL2Q9NX52 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms