Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SLC39A9Q9NUM3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SLC39A9Q9NUM3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms