Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC4Q9NTJ3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms