Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4BQ9NPR2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms