Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00597Q9H2U6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms