Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms