Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms