Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms