Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms