Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF17Q9BXT8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF17Q9BXT8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms