Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD1Q9BXT4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD1Q9BXT4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms