Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SEC22CQ9BRL7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SEC22CQ9BRL7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SEC22CQ9BRL7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SEC22CQ9BRL7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SEC22CQ9BRL7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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