Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM7Q9BQ49 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms