Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms