Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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NIPSNAP1Q9BPW8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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NIPSNAP1Q9BPW8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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