Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF13CQ96RJ3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms