Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms