Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms