Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHAMP1Q96JM3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHAMP1Q96JM3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHAMP1Q96JM3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHAMP1Q96JM3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms