Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NXNL1Q96CM4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms