Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFT1Q96AA3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms