Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCC1Q92922 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms