Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms