Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms