Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10Q8N0Z9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSIG10Q8N0Z9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms