Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDKL3Q8IVW4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms