Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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RAB11FIP4Q86YS3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
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RAB11FIP4Q86YS3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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RAB11FIP4Q86YS3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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RAB11FIP4Q86YS3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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RAB11FIP4Q86YS3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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RAB11FIP4Q86YS3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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RAB11FIP4Q86YS3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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RAB11FIP4Q86YS3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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RAB11FIP4Q86YS3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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RAB11FIP4Q86YS3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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RAB11FIP4Q86YS3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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