Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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