Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP54Q7Z3B4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms