Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TCF23Q7RTU1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms