Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms