Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED9Q6R2W3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED9Q6R2W3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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