Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM46CQ5VWP2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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