Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZFYVE27Q5T4F4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms