Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMPD1Q5SYB0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms