Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D3Q587I9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms