Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms