Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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